Климат в Губахе умеренно-континентальный. Среднегодовая температура около 0 °С. Зимой в январе средняя температура колеблется от -20 до -25 °С, летом в июле около +25 °С. Снежный покров держится 182-200 дней, среднегодовой уровень осадков 400-600 мм.